Nathan Tjoe-A-On telah menjadi milik Swansea City sejak tahun 2023. Namun, ia belum bermain untuk tim utama klub Wales tersebut dan baru dipinjamkan ke Heerenveen di Belanda pada paruh kedua musim 2023/2024.
Kembali ke Swansea City pada musim 2024/2025, Nathan Tjoe-A-On akhirnya mendapatkan kesempatan debutnya di ajang Carabao Cup. Meskipun pada debutnya itu Swansea City kalah 0-1 dari Middlesbrough dalam EFL Championship.
Namun, pada pekan kedua Swansea berhasil menang 3-0 atas Preston North End, dan Nathan Tjoe-A-On mendapat kesempatan bermain sebagai pemain pengganti pada menit ke-88.
