Joey Pelupessy mencatat debut yang mengesankan bersama Timnas Indonesia dalam kemenangan 1-0 atas Bahrain pada 25 Maret 2025. Dalam pertandingan tersebut, Pelupessy tampil penuh selama 90 menit, menunjukkan kontribusi signifikan di matchday 8 Grup C Kualifikasi Piala Dunia 2026 zona Asia. Kemenangan ini bukan hanya menghapus kekecewaan setelah kekalahan dari Australia, tetapi juga menghidupkan kembali harapan Skuad Garuda untuk lolos ke Piala Dunia.
Gelandang berusia 31 tahun ini baru saja menjadi Warga Negara Indonesia pada 10 Maret 2025 dan langsung dipercaya sebagai starter, berduet dengan Thom Haye dalam formasi 4-3-3 yang diterapkan pelatih Patrick Kluivert. Aksinya berhasil memukau ribuan suporter di Stadion Utama Gelora Bung Karno dan jutaan penonton di rumah, menjadikannya idola baru di kalangan penggemar sepak bola Indonesia.
Dalam pertandingan tersebut, Joey Pelupessy berperan sebagai pengatur permainan, menjaga stabilitas tim baik dalam menyerang maupun bertahan. Setelah pertandingan, Pelupessy mengungkapkan rasa bangga dan terima kasih kepada Haye atas dukungannya selama masa adaptasi. Ia juga berbagi pengalaman uniknya terbang jauh ke Australia untuk pertandingan sebelumnya, yang merupakan perjalanan terjauh dalam karirnya sebagai pesepakbola.
